В 1828-1829 годах Лазарев успешно блокировал Дарданеллы, император был доволен результатами.
Еще через два года Египет решил напасть на Турцию, которая не имела союзников и попросила помощи у России. По приказу императора Михаил Лазарев за три недели вооружил эскадру и двинулся для блокировки движения египетского флота. 8 февраля к Буюк-Дере приплыла основная часть кораблей, а через некоторое время подоспели еще две эскадры. Лазарев проявил недюжинный дипломатический талант, в течении полугода не давая возможности египетскому флоту пойти на решительные действия. К тому же русские собирали сведения о проливах и Константинополе. Благодаря этому был подписан выгодный для России договор о плавании в проливах. Турция отплатила щедро, насколько могла, дав возможность беспрепятственно совершать плавание для русских кораблей. В этом немалая заслуга Лазарева, поэтому ему была присвоена должность генерал-адъютанта императора.
Кроме того, его назначили командующим черноморскими портами и флотом. Его усилиями было реформировано руководство флотом, усовершенствованы корабли, оснащены более современным вооружением, гидрографическое депо массово выпускало откорректированные карты Черного моря.